8.5 双变量拟合图 EMP_fitline_plot

模块EMP_fitline_plot可以计算并绘制双变量的拟合线图。

8.5.1 单一组学内数据的双变量拟合

🏷️示例:

## For EMPT
MAE |>
  EMP_assay_extract('geno_ec') |>
  EMP_fitline_plot(var_select=c('1.1.1.1','BMI'),formula = y ~ poly(x, 1))

MAE |>
  EMP_assay_extract('geno_ec') |>
  EMP_fitline_plot(var_select=c('Weight','BMI'),estimate_group='Sex',show='pic')
cooc1 cooc2

8.5.2 多组学之间数据的双变量拟合

注意:
①参数combineMethod提供三种融合p值的方法:fisher,edgington 和 stouffer。
②参数action='get'提取差异性分析结果。

🏷️示例:

## For EMP
k1 <- MAE |>
  EMP_assay_extract('geno_ec') |>
  EMP_decostand(method = 'clr')

k2 <- MAE |>
  EMP_assay_extract('taxonomy') |>
  EMP_collapse(collapse_by='row',estimate_group = 'Class',method = 'sum') |>
  EMP_decostand(method = 'relative')

(k1 + k2) |>
  EMP_fitline_plot(var_select=c('1.1.1.1','Bacilli'),
                   estimate_group='Group',eq_size=2.5)
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