8.5 双变量拟合图 EMP_fitline_plot
模块EMP_fitline_plot可以计算并绘制双变量的拟合线图。
8.5.1 单一组学内数据的双变量拟合
🏷️示例:
## For EMPT
MAE |>
EMP_assay_extract('geno_ec') |>
EMP_fitline_plot(var_select=c('1.1.1.1','BMI'),formula = y ~ poly(x, 1))
MAE |>
EMP_assay_extract('geno_ec') |>
EMP_fitline_plot(var_select=c('Weight','BMI'),estimate_group='Sex',show='pic')


8.5.2 多组学之间数据的双变量拟合
注意:
①参数
②参数
①参数
combineMethod
提供三种融合p值的方法:fisher,edgington 和 stouffer。②参数
action='get'
提取差异性分析结果。
🏷️示例:
## For EMP
k1 <- MAE |>
EMP_assay_extract('geno_ec') |>
EMP_decostand(method = 'clr')
k2 <- MAE |>
EMP_assay_extract('taxonomy') |>
EMP_collapse(collapse_by='row',estimate_group = 'Class',method = 'sum') |>
EMP_decostand(method = 'relative')
(k1 + k2) |>
EMP_fitline_plot(var_select=c('1.1.1.1','Bacilli'),
estimate_group='Group',eq_size=2.5)
